
1966年1月18日,經國務院批準,撤銷額爾古納旗,分設額爾古納左、右兩旗,額爾古納右旗人民委員會駐三河鎮。1969年7月5日,額爾古納右旗隨呼倫貝爾市劃歸黑龍江省管轄。1971年7月,黑龍江省批準額爾古納右旗政府由三河鎮遷至拉布大林鎮。1979年5月30日,額爾古納右旗隨呼倫貝爾盟(今呼倫貝爾市)劃回內蒙古自治區管轄。1994年7月13日,經國務院批準,撤銷額爾古納右旗,改建額爾古納市,以原額爾古納右旗的區域為額爾古納市的行政區域,市人民政府駐拉布大林鎮,隸屬于呼倫貝爾盟行政公署。
1994年,額爾古納市轄10個鄉鎮、6個國營農牧場、1個國家主伐林業局、5個行政村、74個自然屯。
2003年,轄3個鄉、2個鎮、1個辦事處。
2006年,轄2個鄉、2個鎮、2個辦事處、6個國有農牧場、1個國有森林工業公司、1個原始林區管護局、2個國家一類陸路口岸。
2012年,轄2個鄉、3個鎮、2個辦事處、1個蘇木。
2014年,轄3個鄉、3個鎮、2個街道辦事處、1個蘇木。
截至2019年,額爾古納市轄3個鄉、3個鎮、2個街道辦事處、1個蘇木。

1966年1月18日,經國務院批準,撤銷額爾古納旗,分設額爾古納左、右兩旗,額爾古納右旗人民委員會駐三河鎮。1969年7月5日,額爾古納右旗隨呼倫貝爾市劃歸黑龍江省管轄。1971年7月,黑龍江省批準額爾古納右旗政府由三河鎮遷至拉布大林鎮。1979年5月30日,額爾古納右旗隨呼倫貝爾盟(今呼倫貝爾市)劃回內蒙古自治區管轄。1994年7月13日,經國務院批準,撤銷額爾古納右旗,改建額爾古納市,以原額爾古納右旗的區域為額爾古納市的行政區域,市人民政府駐拉布大林鎮,隸屬于呼倫貝爾盟行政公署。
1994年,額爾古納市轄10個鄉鎮、6個國營農牧場、1個國家主伐林業局、5個行政村、74個自然屯。
2003年,轄3個鄉、2個鎮、1個辦事處。
2006年,轄2個鄉、2個鎮、2個辦事處、6個國有農牧場、1個國有森林工業公司、1個原始林區管護局、2個國家一類陸路口岸。
2012年,轄2個鄉、3個鎮、2個辦事處、1個蘇木。
2014年,轄3個鄉、3個鎮、2個街道辦事處、1個蘇木。
截至2019年,額爾古納市轄3個鄉、3個鎮、2個街道辦事處、1個蘇木。